تهدف إدارة المراجعة الداخلية إلى فحص وتقويم درجة كفاية نظام الرقابة الداخلية داخل وذلك بغرض تحسين عمليات الوحدة وتساعد المراجعة الداخلية الإدارة العليا بالجامعة في تحقيق أهدافها من خلال تطبيق مدخل منظم التقديم وتحسين فاعلية نظام الرقابة الداخلية، فالهدف الأساسي للمراجعة الداخلية هو مساعدة إدارة الجامعة في القيام بمسؤوليتها عن طريق فحـص وتقويم وإبداء الرأي في السياسات والخطط والإجراءات والسجلات.